Authors: Huuhtanen, Jani, Kasanen, Henna, Peltola, Katriina, Lönnberg, Tapio, Glumoff, Virpi, Brück, Oscar, Dufva, Olli, Peltonen, Karita, Vikkula, Johanna, Jokinen, Emmi, Ilander, Mette, Lee, Moon Hee, Mäkelä, Siru, Nyakas, Marta, Li, Bin, Hernberg, Micaela, Bono, Petri, Lähdesmäki, Harri, Kreutzman, Anna, Mustjoki, Satu
Superior Title: Huuhtanen , J , Kasanen , H , Peltola , K , Lönnberg , T , Glumoff , V , Brück , O , Dufva , O , Peltonen , K , Vikkula , J , Jokinen , E , Ilander , M , Lee , M H , Mäkelä , S , Nyakas , M , Li , B , Hernberg , M , Bono , P , Lähdesmäki , H , Kreutzman , A & Mustjoki , S 2023 , ' Single-cell characterization of anti-LAG-3 and anti-PD-1 combination treatment in patients with melanoma ' , Journal of ....
Subject Terms: Humans, Programmed Cell Death 1 Receptor, Melanoma/drug therapy, Nivolumab/therapeutic use, Antineoplastic Agents/pharmacology, CD8-Positive T-Lymphocytes, Receptors, Antigen, T-Cell/metabolism, Melanoma, Cutaneous Malignant, Immunology, T cells, Skin cancer, Oncology, NK cells
File Description: application/pdf
Authors: Huuhtanen, Jani, Lundgren, Sofie, Keränen, Mikko, Feng, Xingim, Dulau-Florea, Alina, Patel, Bhavisha, Zaimoku, Yoshitaka, Kerr, Cassandra, Jokinen, Emmi, Heinonen, Markus, Rajala, Hanna, Siitonen, Sanna, Ebeling, Freja, Ryland, Georgina, Fox, Lucy, Blombery, Piers, Hellström-Lindberg, Eva, Maciejewski, Jaroslaw P., Young, Neal S., Lähdesmäki, Harri, Mustjoki, Satu
Superior Title: HemaSphere ; volume 7, issue S3, page e2285644 ; ISSN 2572-9241
Subject Terms: Hematology
Availability: https://doi.org/10.1097/01.hs9.0000967616.22856.44
Authors: Korpela, Dani, Jokinen, Emmi, Dumitrescu, Alexandru, Huuhtanen, Jani, Mustjoki, Satu, Lähdesmäki, Harri
Contributors: Cowen, Lenore, Academy of Finland, Sigrid Juselius Foundation, Cancer Foundation Finland
Superior Title: Bioinformatics ; volume 39, issue 12 ; ISSN 1367-4811
Subject Terms: Computational Mathematics, Computational Theory and Mathematics, Computer Science Applications, Molecular Biology, Biochemistry, Statistics and Probability
Authors: Jokinen, Emmi, Dumitrescu, Alexandru, Huuhtanen, Jani, Gligorijevic, Vladimir, Mustjoki, Satu, Bonneau, Richard, Heinonen, Markus, Lähdesmäki, Harri
Contributors: Biotekniikan instituutti, Tietojenkäsittelytieteen osasto, Helsingin yliopisto, Helsinki Institute of Life Science HiLIFE, TRIMM - Translational Immunology Research Program, HUS Syöpäkeskus, Hematologian yksikkö, Kliinisen kemian ja hematologian osasto, Clinicum, Digital Precision Cancer Medicine (iCAN)
Subject Terms: 1182 Biokemia, solu- ja molekyylibiologia, 11832 Mikrobiologia ja virologia
File Description: application/pdf
Relation: https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btac788; Bioinformatics; Jokinen , E , Dumitrescu , A , Huuhtanen , J , Gligorijevic , V , Mustjoki , S , Bonneau , R , Heinonen , M & Lähdesmäki , H 2023 , ' TCRconv : predicting recognition between T cell receptors and epitopes using contextualized motifs ' , Bioinformatics , Vuosikerta. 39 , Nro 1 , btac788 . https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btac788; PURE: 258118961; PURE UUID: 120b86bd-4a1f-4dce-908c-4516f725e9cc; WOS: 000935218800001; PubMed: 36477794; ORCID: /0000-0002-0816-8241/work/130605559; http://hdl.handle.net/10138/356034
Authors: Dumitrescu, Alexandru, Jokinen, Emmi, Paatero, Anja, Kellosalo, Juho, Paavilainen, Ville O., Lähdesmäki, Harri
Contributors: Department of Computer Science, Professorship Lähdesmäki Harri, University of Helsinki, Computer Science Professors, Aalto-yliopisto, Aalto University
File Description: application/pdf
Relation: Bioinformatics; Volume 39; Dumitrescu , A , Jokinen , E , Paatero , A , Kellosalo , J , Paavilainen , V O & Lähdesmäki , H 2023 , ' TSignal : a transformer model for signal peptide prediction ' , Bioinformatics , vol. 39 , pp. I347-I356 . https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btad228; PURE UUID: d94277d9-e5bd-411b-903d-8e71234fb475; PURE ITEMURL: https://research.aalto.fi/en/publications/d94277d9-e5bd-411b-903d-8e71234fb475; PURE LINK: http://www.scopus.com/inward/record.url?scp=85163693976&partnerID=8YFLogxK; PURE FILEURL: https://research.aalto.fi/files/116879557/TSignal_a_transformer_model_for_signal_peptide_prediction.pdf; https://aaltodoc.aalto.fi/handle/123456789/122273; URN:NBN:fi:aalto-202308014634
Authors: Huuhtanen, JaniAff1, Aff2, Aff3, Aff4, Chen, LiangAff5, Aff6, Jokinen, Emmi, Kasanen, HennaAff1, Aff2, Aff3, Lönnberg, TapioAff7, Aff8, Kreutzman, AnnaAff1, Aff2, Aff3, Peltola, KatriinaAff3, Aff9, Hernberg, Micaela, Wang, ChunlinAff5, Aff6, Yee, CassianAff10, Aff11, Lähdesmäki, Harri, Davis, Mark M.Aff5, Aff6, Aff12, IDs4146702233720z_cor12, Mustjoki, SatuAff1, Aff2, Aff3, Aff13, IDs4146702233720z_cor13
Superior Title: Nature Communications. 13(1)
Authors: Jokinen, Emmi, Dumitrescu, Alexandru, Huuhtanen, Jani, Gligorijević, Vladimir, Mustjoki, Satu, Bonneau, Richard, Heinonen, Markus, Lähdesmäki, Harri
Superior Title: Bioinformatics
Subject Terms: Original Paper
Relation: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC9825763/; http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/36477794; http://dx.doi.org/10.1093/bioinformatics/btac788
Authors: Voutilainen, SanniAff1, Heinonen, MarkusAff2, Aff3, Andberg, Martina, Jokinen, Emmi, Maaheimo, Hannu, Pääkkönen, Johan, Hakulinen, Nina, Rouvinen, Juha, Lähdesmäki, Harri, Kaski, SamuelAff2, Aff3, Rousu, JuhoAff2, Aff3, Penttilä, Merja, Koivula, Anu
Superior Title: Applied Microbiology and Biotechnology. 104(24):10515-10529
Contributors: TRIMM - Translational Immunology Research Program, Department of Clinical Chemistry and Hematology, University of Helsinki, HUS Comprehensive Cancer Center, Department of Oncology, Research Programs Unit, Hematologian yksikkö, Digital Precision Cancer Medicine (iCAN)
Subject Terms: 3111 Biomedicine, 1182 Biochemistry, cell and molecular biology
File Description: application/pdf
Relation: https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1008814; PLoS Computational Biology; Jokinen , E , Huuhtanen , J , Mustjoki , S , Heinonen , M & Lähdesmäki , H 2021 , ' Predicting recognition between T cell receptors and epitopes with TCRGP ' , PLoS Computational Biology , vol. 17 , no. 3 , 1008814 . https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1008814; PURE: 164865169; PURE UUID: bf9bcf9f-569f-4812-acaf-8197d27759aa; WOS: 000634792900003; ORCID: /0000-0002-0816-8241/work/95320695; http://hdl.handle.net/10138/330821
Authors: Jokinen, Emmi, Heinonen, Markus, Lähdesmäki, Harri
Relation: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6022679/; http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/29949987; http://dx.doi.org/10.1093/bioinformatics/bty238
Authors: Jokinen, Emmi
Subject Terms: fi=Hoitotyö|sv=Vård|en=Nursing, liikunta, raskaus, äitiysneuvolat, liikuntaneuvonta, Terveyspalvelujen johtaminen ja kehittäminen
Relation: http://www.theseus.fi/handle/10024/783854; URN:NBN:fi:amk-2022112924877
Availability: http://www.theseus.fi/handle/10024/783854
Authors: Jokinen Emmi, Hernberg Micaela, Huuhtanen Jani, Lähdesmäki Harri, Chen Liang, Wang Chunlin, Lönnberg Tapio, Kreutzman Anna, Peltola Katriina, Mustjoki Satu, Davis Mark M, Yee Cassian, Kasanen Henna
Contributors: Turun biotiedekeskus, Turku Bioscience Centre, InFLAMES lippulaiva, tutkimus, InFLAMES Flagship, research, 2609201, 2607051
Relation: 13; 5988; Nature Communications; https://www.utupub.fi/handle/10024/173272; https://www.nature.com/articles/s41467-022-33720-z; URN:NBN:fi-fe2022112967815
Authors: Bouhlal, Jonas, Nygren, Petra, Jokinen, Emmi, Laajala, Essi, Ianevski, Aleksandr, Dias, Diogo, Klievink, Jay, Lähteenmäki, Hanna, Duàn, Hanna, Saeed, Khalid, Lee, Dean Anthony, Aittokallio, Tero, Dufva, Olli, Mustjoki, Satu
Superior Title: Blood; November 2023, Vol. 142 Issue: 1, Number 1 Supplement 1 p3634-3634, 1p
Authors: Duàn, Hanna, Dufva, Olli, Jokinen, Emmi, Lähteenmäki, Hanna, Klievink, Jay, Bouhlal, Jonas, Theodoropoulos, Jason, Kuusanmäki, Heikki, Ruokoranta, Tanja, Rumm, Pauliina, Lee, Dean Anthony, Pitkänen, Esa, Mäkelä, Tomi P, Porkka, Kimmo, Brück, Oscar, Mustjoki, Satu
Superior Title: Blood; November 2023, Vol. 142 Issue: 1, Number 1 Supplement 1 p66-66, 1p
Authors: Jokinen, Emmi
Subject Terms: Herbalife, painonnousu, ylipaino, lihavuus, laihdutus, ryhmät, painonhallinta
File Description: 1 verkkoaineisto (62 sivua); application/pdf; fulltext
Relation: oai:jykdok.linneanet.fi:1529546; URN:NBN:fi:jyu-201604302372; http://urn.fi/URN:NBN:fi:jyu-201604302372
Availability: http://urn.fi/URN:NBN:fi:jyu-201604302372
Authors: Jokinen, Emmi
Contributors: Heinonen, Markus, Sähkötekniikan korkeakoulu, Lähdesmäki, Harri, Aalto-yliopisto, Aalto University
Subject Terms: protein stability, Gaussian processes, graph kernels, MKL
File Description: application/pdf
Relation: https://aaltodoc.aalto.fi/handle/123456789/21609; URN:NBN:fi:aalto-201608263065
Availability: https://aaltodoc.aalto.fi/handle/123456789/21609
Authors: Jokinen, Emmi
Contributors: Helsingin yliopisto, Maatalous-metsätieteellinen tiedekunta, University of Helsinki, Faculty of Agriculture and Forestry, Helsingfors universitet, Agrikultur- och forstvetenskapliga fakulteten
Subject Terms: Kaura, tärkkelys, liisteröityminen, uuskiteytyminen, vanheneminen, Elintarviketieteiden maisteriohjelma, Master's Programme in Food Sciences, Magisterprogrammet i livsmedelsvetenskaper, ei opintosuuntaa, no specialization, ingen studieinriktning
Relation: URN:NBN:fi:hulib-202006092672; http://hdl.handle.net/10138/316048
Availability: http://hdl.handle.net/10138/316048
Authors: Jokinen, Emmi, Kokkomäki, Sanna
Contributors: Tampereen ammattikorkeakoulu
Subject Terms: matkailu, terveysneuvonta, ennaltaehkäisy, terveysriskit, matkailijat, rokotteet, Terveydenhoitotyön suuntautumisvaihtoehto, fi=Hoitotyö|sv=Vård|en=Nursing, Hoitotyön koulutusohjelma
Relation: URN:NBN:fi:amk-2013111417007; http://www.theseus.fi/handle/10024/65276; 10024/182
Availability: http://www.theseus.fi/handle/10024/65276
Authors: Jokinen, Emmi, Kokkomäki, Sanna
Contributors: Tampereen ammattikorkeakoulu
Subject Terms: matkailu, terveysneuvonta, ennaltaehkäisy, terveysriskit, matkailijat, rokotteet, Terveydenhoitotyön suuntautumisvaihtoehto, fi=Hoitotyö|sv=Vård|en=Nursing, Hoitotyön koulutusohjelma, socio, manag
Relation: http://www.theseus.fi/handle/10024/65276
Availability: http://www.theseus.fi/handle/10024/65276
Authors: Jokinen, Emmi
Contributors: Intosalmi, Jukka, Sähkötekniikan korkeakoulu, Turunen, Markus, Aalto-yliopisto, Aalto University
Subject Terms: T-solut, auttaja-T-solujen erilaistuminen, mallinnus
File Description: application/pdf
Relation: https://aaltodoc.aalto.fi/handle/123456789/12069; URN:NBN:fi:aalto-201501221412
Availability: https://aaltodoc.aalto.fi/handle/123456789/12069